標本典藏

• 從事野外標本採集，採集資訊建檔整理、物種鑑定、查對學名等經常性工作。此外，近年來更加緊進行典藏標本數位化檔案之製作，典藏目錄整理編訂等任務。
• 為維護標本典藏品質，本館標本典藏室內採用活動式軌道標本櫃，估計約可供容納 200 萬份標本。並不定期進行設施改善。
• 與國內外其它標本館進行複份標本交流工作，以充實本館典藏內容。

學術研究

• 進行台灣高等維管束植物之系統分類研究，並不定期發表相關學術論文。
• 參與台灣植物誌新版之修訂工作。
• 協助本所各單位及外界植物之調查及鑑定工作。
• 館內目前典藏微縮影片，內容包括歐洲數家標本館之標本及模式標本影像資料，以及許多植物研究及植物分類學相關之期刊文獻翻拍影像資料，並建置線上目錄查詢供各界人士查閱。
• 蒐集典藏植物分類相關書籍、各國植物誌、植物圖鑑及植物系統分類專書等參考書籍。

查閱標本及參觀服務

• 本館提供植物分類之相關研究人士查閱標本，及學校團體參觀教學服務。學校團體如欲參觀，需事先來函申請，以便安排參觀事宜。(對於一般遊客，暫不考慮開放，敬請見諒)。

鑑定服務

• 本館提供全國各機關、學校及社會人士有關植物標本之鑑定服務。如需此項服務者，請將欲鑑定之標本 ( 以花、果、葉齊全之新鮮標本為佳 ) 以包裹或信函郵寄，並註明採集時間、地點、海拔，本館將以最快速度回覆。 (本館通常並不會將鑑定標本寄還，故請先行編號記錄，以便答覆。)